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解析:根据山羊高热咳嗽、呼吸困难，镜检见丝状支原体，马琼脂培养基7天长出“荷包蛋状”菌落等特征可以诊断该羊患有山羊传染性胸膜肺炎。是由丝状支原体山羊亚种、山羊支原体山羊肺炎亚种等引起山羊的一种特有的高度接触性传染病，以急性纤维素性胸膜肺炎为特征，临床主要表现为高热、咳嗽、呼吸困难、流产等。